本所為台灣第一所以研究大腦機制與人類行為關係的研究所，於 2003年9月成立至今已建立情緒與犯罪實驗室(Emotion and Criminology Laboratory)、心理物理學行為實驗室 (Psychophysical and Behavioral Laboratory)、事件誘發電位腦波偵測實驗室 (ERPs Laboratory)、穿顱磁波刺激實驗室 (Transcranial Magnetic Stimulation Laboratory) 、神經語言學實驗室(Neurolinguistic Laboratory)及行動與認知實驗室(Action and Cognition Laboratory)。 　　目前本所與同為台灣聯合大學系統中之陽明大學認知神經心理學實驗室、神經科學研究所、台北榮總教學研究部整合性腦功能研究室 (IBRU, Taipei-VGH)、中央研究院語言所、以及交通大學腦科學中心已有密切的合作關係 ，以多種腦造影技術與行為測量的方法來研究各種認知功能在腦內的處理機制。例如：失讀症、中文字詞處理、工作記憶與閱讀歷程、視覺認知及視覺搜尋、情緒與犯罪行為、以及人類運動控制與認知能力。 　 　 認知所成員合影  2008年11月04號

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